Ποτέ ένα οικογενειακό όχημα δεν είχε τόσα πολλά συστήματα υποβοήθησης οδηγού για την προστασία έναντι επικίνδυνων καταστάσεων. Για παράδειγμα, το Octavia Sports Wagon μπορεί τώρα να διαχειρίζεται καταστάσεις όπως: να καταγράφει την κυκλοφορία στο αντίθετο ρεύμα, όταν στρίβετε προς τα αριστερά και ακινητοποιεί το όχημα, εφόσον υπάρξει κίνδυνος. Μόλις σταθμεύσετε το όχημά σας, παρακολουθεί την περιοχή πίσω και σας προειδοποιεί σε περίπτωση κινδύνου ή ενδεχόμενης σύγκρουσης με άλλο όχημα ή ποδηλάτη κατά το άνοιγμα της πόρτας.

Σε περίπτωση ατυχήματος, οι επιβάτες προστατεύονται από ένα στιβαρό αμάξωμα με μεγάλες ζώνες παραμόρφωσης και έως και 10 αερόσακους, παρέχοντας αλληλεπίδραση υψηλής ακρίβειας με αυτόματες ζώνες ασφαλείας τριών σημείων και προσκέφαλα ασφαλείας. Άλλα χαρακτηριστικά ασφαλείας περιλαμβάνουν σύγχρονα ηλεκτρονικά συστήματα που έχουν σχεδιαστεί για να μετριάζουν τις συνέπειες ενός ατυχήματος, όπως η πέδηση πολλαπλών συγκρούσεων και το Crew Protect Assist εμπρός και πίσω.

Το Octavia Sports Wagon διαθέτει το σύστημα eCall το οποίο μεταδίδει πληροφορίες όπως η θέση του αυτοκινήτου, ο αριθμός των επιβατών, η θέση του αυτοκινήτου πριν και μετά το ατύχημα και η κατάσταση σε περίπτωση ατυχήματος. Μπορεί επίσης να ενεργοποιηθεί χειροκίνητα ανά πάσα στιγμή μέσω πλήκτρων στη μονάδα οροφής.

Στο Euro NCAP το Skoda Octavia συγκέντρωσε με πέντε αστέρια την υψηλότερη δυνατή βαθμολογία, κάτι που αποδεικνύει την ιδανική προστασία των επιβατών του αυτοκινήτου.

Στην κατηγορία Προστασία Ανήλικων Επιβατών, το Octavia έλαβε βαθμολογία 88% από τους συνολικούς βαθμούς. Έτσι το Octavia κατετάγη στην κορυφή όλων των οχημάτων που δοκιμάστηκαν. Στην κατηγορία Προστασία Ενήλικων Επιβατών, το Octavia έλαβε βαθμολογία 92% από τους συνολικούς βαθμούς.